物流園區(qū)與保稅區(qū)的區(qū)別如下：

1、特點不同

物流園區(qū)的物流組織和服務(wù)功能不同于單一任務(wù)的配送中心或具有一定專業(yè)性的物流中心，其功能特性體現(xiàn)在多種作業(yè)方式的綜合、集約等特點，包括倉儲、配送、貨物集散、集拼箱、包裝、加工以及商品的交易和展示等諸多方面。同時也體現(xiàn)在技術(shù)、設(shè)備、規(guī)模管理等方面的集約。

而保稅區(qū)運行系統(tǒng)的協(xié)調(diào)表現(xiàn)為在對線路和進出量調(diào)節(jié)上。保稅區(qū)的這一功能體現(xiàn)為其指揮、管理和信息中心功能，通過信息的傳遞、集中和調(diào)配，使多種運行系統(tǒng)協(xié)調(diào)共同為保稅區(qū)各物流中心服務(wù)。

2、功能不同

物流園區(qū)作為城市物流功能區(qū)，物流園區(qū)包括物流中心、配送中心、運輸樞紐設(shè)施、運輸組織及管理中心和物流信息中心，以及適應(yīng)城市物流管理與運作需要的物流基礎(chǔ)設(shè)施；作為經(jīng)濟功能區(qū)，其主要作用是開展?jié)M足城市居民消費、就近生產(chǎn)、區(qū)域生產(chǎn)組織所需要的企業(yè)生產(chǎn)和經(jīng)營活動。

而保稅區(qū)的貨物可以進行儲存、改裝、分類、混合、展覽，以及加工制造，但必須處于海關(guān)監(jiān)管范圍內(nèi)。外國商品存入保稅區(qū)，不必繳納進口關(guān)稅，尚可自由進出，只需交納存儲費和少量費用，但如果要進入關(guān)境則需交納關(guān)稅。

各國的保稅區(qū)都有不同的時間規(guī)定，逾期貨物未辦理有關(guān)手續(xù)，海關(guān)有權(quán)對其拍賣，拍賣后扣除有關(guān)費用后，余款退回貨主。

3、政策不同

物流園區(qū)企業(yè)經(jīng)營范圍中涉及國內(nèi)貿(mào)易的，如果不涉及許可類貿(mào)易項目同樣不需要經(jīng)過任何審批就可以將其列入企業(yè)營業(yè)執(zhí)照的經(jīng)營范圍。但實踐中很多保稅區(qū)內(nèi)的工商部門對于此類業(yè)務(wù)并不予以營業(yè)執(zhí)照確認。其理由仍然是保稅區(qū)管理的特殊性，非保稅區(qū)業(yè)務(wù)會不利于海關(guān)及相關(guān)部門對保稅業(yè)務(wù)的監(jiān)管。

而保稅區(qū)實行封閉管理，境外貨物進入保稅區(qū)，實行保稅管理；境內(nèi)其他地區(qū)貨物進入保稅區(qū)，視同出境；同時，外經(jīng)貿(mào)、外匯管理等部門對保稅區(qū)也實行較區(qū)外相對優(yōu)惠的政策，同時保稅區(qū)具有進出口加工、國際貿(mào)易、保稅倉儲商品展示等功能，享有“免證、免稅、保稅”政策,實行“境內(nèi)關(guān)外”運作方式。